Berlatar di Akademi Shiomi, sekolah tersebut memiliki Daitoshokan (perpustakaan raksasa) yang besar. Disana terdapat sebuah legenda yang menyebutkan apabila seseorang bekerja keras maka akan datang seseorang misterius yang dikenal dengan sebutan “Gembala” datang dan mengabulkan permintaan mereka. Bercerita tentang seorang siswa bernama Kyotarou Kakei, ia merupakan anggota dari Klub Pustaka, setiap hari yang ia lakukan hanya membaca buku di Daitoshokan. Pagi ini merupakan awal baru baginya, ia menerima pesan dari “Gembala” yang menyebutkan kalau nasibnya akan berubah. Dan karena serangkaian kejadian ia pun bertemu dengan seseorang gadis bernama Tsugumi Shirasaki yang akhirnya bergabung dengan Klub Pustaka, dan perlahan banyak yang telah tergabung dengan Klub tersebut. Apakah ini yang diharapkan oleh “Gembala”, dan siapakah dia sebenarnya?